Em Ghost of Yotei, você aumenta sua saúde coletando fontes termais. Existem 16 fontes termais no total, e cada uma delas aumenta um pouco a saúde. Toda região tem algumas delas, e algumas regiões estão brigadas com o progresso da história. Os de Yotei Grasslands, Tokachi Range e Nayoro Wilds são acessíveis desde o início. As outras regiões são desbloqueadas do progresso da história.
As fontes termais são pequenas piscinas de água cercadas por pedras e uma árvore. Interaja com o balde nas fontes termais para tomar banho nelas. Você terá a opção de refletir sobre os eventos do jogo, mas nunca importa o que você escolhe. Após cerca de um minuto sentado na fonte termal, você receberá o aumento da saúde.
Como o jogo não usa um sistema de nivelamento, não há como "subir de nível". Hot Springs são a única maneira de melhorar permanentemente a saúde. No entanto, você pode cozinhar refeições nos acampamentos para ganhar fãs passivas. Você também pode equipar os encantos (por exemplo, de escalas do santuário e outras atividades) e armaduras para obter mais fãs passivas. Você também pode orar com altares de reflexão para desbloquear novas habilidades e completar ataques de bambu para aumentar o espírito usado para ataques especiais.
